La oficina central de Benchmark Genetics Chile tiene su sede en el centro de la ciudad de Puerto Varas, a orillas del lago Llanquihue. Puerto Varas se encuentra a 25 Km de Puerto Montt, conocida como la Capital Chilena de la Producción de Salmón, y alberga la mayoría de las sedes y operaciones de las mayores empresas salmoneras chilenas.