This website uses cookies so that we can provide you with the best user experience possible. Cookie information is stored in your browser and performs functions such as recognising you when you return to our website and helping our team to understand which sections of the website you find most interesting and useful.
Kvalitetsegenskaper for laks
Filetfarge er et av de mest interessante arvelige egenskapene hos atlantisk laks. Vi måler fenotype både manuelt ved bruk av SalmoFan og ved bruk av spektroskopi. Vi har også anvendt metoden nær-infrarød spektroskopi (NIR), enten som et målepunkt i henhold til Norwegian Quality Cut (NQC) eller som et gjennomsnittsmål for hele fileten. Innenfor en populasjon av laks er det en stor forskjell i hvor mye astaxantin per kg som man måler i den enkelte filet. Derfor er denne egenskapen mulig å forbedre gjennom selektert avl (Figur 1). Filetpigment blir målt og registrert hvert år på fullsøsken av våre avlskandidater i et testslakt.
SNP markører
For hver genetisk egenskap, vil SNP markørene, som er jevnt distribuert utover laksens genom, bidra forskjellig. For å kartlegge hver markørs bidrag til filetfarge, blir det tatt en prøve fra fettfinnen til fisken. Denne blir genotypet og knyttet opp mot fenotypen til hvert enkelt individ. Vi foretar en genomvid assosiasjonsstudie (GWAS) av prøven. For SalmoBreedstammens 2015-årsklasse ble det foretatt genotype av 1698 fisk ved bruk av en spesialdesignet Affymetrix SNP array, NOFSAL03, som består av mer enn 50.000 SNP markører.
En GWAS var også ble også benyttet til å koble individuelle målinger av mg/kg-1 astaxanthin i hele fileten til det genomiske uttrykket (Figur 2). Den grafiske fremstillingen, et såkalt manhattan plot, viser at det er én QTL som i større grad enn andre bidrar til å forklare pigmenteringsnivået. Den viser også at det er andre områder på genomet som også bidrar til den genetiske variasjonen, men i mye mindre grad.
Benchmark tilbyr GS og QTL for pigmentering. Siden 2017 har disse teknologiene blitt implementert for å forbedre kvaliteten på fenotypene. Filetfarge har vært en egenskap som vi har selektert for i avlsprogrammet til SalmoBreed-stammen siden 2005. Målet har vært å forbedre filetpigmentering jevnt og trutt for hver generasjon av stamfisken i vår avlskjerne. Egenskapen vi har kalt GS Quality benytter GS for seleksjon for økt produksjonsutbytte i tillegg til QTL for pigmentering.
