Seleksjonsmetoder

Benchmark Genetics’ interne avlsprogrammer er alle basert på familieseleksjon.

Hvorfor familiebasert seleksjon?

Før innføringen av familiebasert seleksjon var det bare mulig å velge stamfisk som foreldre til neste generasjon basert på deres egen prestasjon, og kun for egenskaper som kunne måles direkte på individet.

Familiebasert seleksjon innebærer at det samles inn data fra søsken av aktuelle stamfisk for egenskaper som ikke kan måles direkte på stamfisken selv. Dette gjelder blant annet sykdomsresistens, filetutbytte og filet­farge. Ved å sammenligne familier for ulike egenskaper som er viktige i kommersiell produksjon, kan vi med høy presisjon identifisere familier med spesifikke genetiske fordeler. Familiebasert seleksjon er også en effektiv metode for å minimere innavlsnivået, ettersom vi har full kontroll på slektskapsinformasjonen for hver familie

QTL – Quantitative Trait Locus

En QTL (kvantitativt egenskapslocus) er et område i genomet som påvirker en bestemt egenskap, for eksempel sykdomsresistens eller vekst. Noen egenskaper styres av mange gener med små effekter, mens andre kan være sterkt påvirket av én eller få QTL-er.

For egenskaper der noen få QTL-er har stor betydning, kan man selektere direkte på disse ved hjelp av markørassistert seleksjon (MAS).

Hos atlantisk laks ble en viktig QTL for resistens mot IPN-virus identifisert i 2007. Denne ene QTL-en forklarer over 80 % av den genetiske variasjonen i IPN-resistens. Derfor har målrettet seleksjon på denne markøren gitt en markant reduksjon i IPN-relatert dødelighet siden metoden ble tatt i bruk i 2009. SNP-markører som viser om fisken bærer denne QTL-en, brukes både i avlskjernen og i kommersiell rognproduksjon. Det gjør at genetisk resistente individer velges ut, og dermed reduseres både antall og alvorlighetsgrad av IPN-utbrudd.

IPN-QTL-en er et av de tydeligste eksemplene på hvordan genetikk kan brukes til å kontrollere en infeksjonssykdom i oppdrett. Selv om forskningen finner nye QTL-er for andre egenskaper, har disse som regel mindre effekt. For de fleste egenskaper skyldes variasjonen mange gener som hver bidrar litt. I slike tilfeller er genomisk seleksjon en mer treffsikker og effektiv metode.

Markørassistert seleksjon er en svært effektiv metode når en QTL med stor effekt forklarer mesteparten av den genetiske variasjonen for en egenskap. For de fleste egenskaper er det imidlertid mange gener som hver bidrar med små effekter. I slike tilfeller er genomisk seleksjon (GS) en bedre metode for å identifisere hvilke individer som bør brukes i avl.

Egenskaper der genomisk seleksjon brukes, inkluderer blant annet vekst, utsatt kjønnsmodning, sykdomsresistens og filet­kvalitet.

Våre avlsprogrammer for atlantisk laks er internasjonalt anerkjent for å levere produkter av høy kvalitet, nettopp fordi vi bruker genomisk seleksjon på viktige egenskaper.